Como visto, a análise genética do embrião pode ser direcionada a objetivos específicos de acordo com o caso, sendo fundamental que o especialista faça o levantamento do histórico familiar e individual do casal para determinar qual conduta é mais adequada.
Considerando as particularidades de cada caso, o PGT-M pode ser indicado para as seguintes situações, de acordo com recomendação do Conselho Federal de Medicina (CFM)

Diagnóstico Genético Pré Implantacional (PGT)
O diagnóstico genético pré implantacional (PGT) pode ser realizado durante o procedimento de Fertilização in Vitro.
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Histórico familiar de doenças gênicas;
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Alteração genética entre os progenitores que pode ser transmitida aos filhos;
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Casais com filhos portadores de patologias nas quais o tratamento recomendado seja o transplante de células-tronco de doador compatível;
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Casais que já tiveram filhos com malformação.
Quando o teste genético é recomendado?
Quais são as vantagens de realizar o PGT?
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Menos tempo para conseguir uma gestação;
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Redução no número de transferências embrionárias;
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Menores chances de aborto;
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Maiores chances de implantação embrionária;
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Menores taxas de gestação múltipla.
O PGT diminui o risco de abortamento, o tempo de tentativas de fertilização in vitro,
além de diminuir a chance de nascimentos com anormalidade genéticas (aquelas passíveis de diagnóstico na fase embrionária).